当发动机发生晃动且不能运转时，应该停车进行检查。

发动机晃动的原因有以下几种：

1、气缸不足。检查气缸导线，更换有问题的导线，比如没有火的导线、质量较差的导线或者采用正规厂家的导线。同时，过低的怠速会导致发动机稳定角恶化，需要进行交换。其他可能导致气缸不足的原因还包括电装品接触不良、点火线圈有问题、空气流量计发生故障等等。

2、汽车行驶一定距离后，节流阀太脏，节流阀关闭不严，怠速步进电机堵塞，导致发动机怠速过高。

3、由于发动机工作中产生的积碳，车辆可能会晃动。特别是在起动车辆时，发动机有时会比通常稍有晃动，出现不能一次起动的现象。

针对以上情况，需要进行相应的检查和维修处理，以确保发动机的正常工作和车辆的安全行驶。