在低负荷工况下，会造成相当大剂量的NOx(氮氧化物)和高温，这就需要非常高的三元催化转化器。

缸内直喷技术对一些硬件设施的要求也非常高，比如需要配备高压喷油器，提高油气的雾化程度和混合效率；缸内直喷系统的发动机在材质上更加精致，甚至连活塞和燃烧室的形状也因为分层燃烧时气流方向的调整而基本需要特殊设计。最重要的是，缸内直喷需要质量稳定的高标号燃油。

缸内直喷不能像进气歧管喷射那样被汽油冲刷气门背面，时间长了会影响发动机严重积碳。气门背面有一层厚厚的积碳，会影响ECU对进气的判断。如果严格禁止，会影响起步难度。