发动机故障保护系统的功能，简单来说就是在电控系统工作时，当微电脑检测到某些传感器、执行器及其控制电路出现故障时，微电脑会根据预存的程序控制发动机继续工作或停止工作，以保护发动机。故障安全系统依靠ECU中的软件来完成其功能。
当发动机ECU中的微处理器或少数重要传感器出现故障时，ECU根据预存的程序控制燃油喷射系统和点火正时，使电控系统维持最基本的控制功能，保持发动机运转，这是紧急备用功能，由ECU的备用IC(集成电路)完成。
紧急设置的标准信号包括：
1. 冷却液温度信号THW：当冷却液温度传感器或其电路出现故障时，防故障系统会向ECU提供设定的冷却液温度信号，通常控制发动机按照80的冷却液温度工作。
2. 进气温度信号THA：当空气温度传感器或其电路出现故障时，防故障系统会向ECU提供设定的进气温度信号，通常控制发动机按照20的进气温度工作。
3. 节气门位置信号(线性类型)：当节气门位置传感器或其电路出现开路或短路故障时，故障安全系统使ECU根据设定的节气门位置传感器信号控制发动机。
4. 爆震传感器信号：当爆燃传感器或其电路出现故障时，点火提前角都无法得到爆燃控制系统的反馈控制，会导致发动机无法正常工作。故障安全系统使ECU将点火提前角固定在适当的值。
5. 点火确认信号IGF：当点火系统故障或IGT未能触发IGF时，故障安全系统使ECU立即切断燃油喷射并停止发动机。
6. 凸轮轴位置传感器信号：当凸轮轴位置传感器及其G1、G2信号电路短路或开路时，防故障系统使ECU根据保留的G信号判断曲轴参考角度。如果不能接收到G信号，紧急备用系统只能用来保持发动机运转。
7. 空气流量计信号：当空气流量计或其电路出现故障时，故障安全系统根据起动信号和节气门位置传感器信号，使ECU控制发动机在固定的喷射时间工作。
8. 进气歧管绝对压力传感器信号：在D型电控燃油喷射系统中，如果进气管绝对压力传感器或其电路出现故障，故障-安全系统使ECU根据设定的定值控制喷油量，或者启动紧急备用系统保持发动机运转。
