跑胶拖带,这可真是个让人头疼的问题!为啥会拖带呢?其实原因有不少,咱一个个来说道说道。
PCR 产物出现拖尾,这可能是因为非特异性扩增太多了。比如说,模板不纯、Buffer 不合适、退火温度偏低、酶量过多、dNTP 和镁离子浓度偏高、循环次数过多或者模板量少、引物量过多,这些都可能导致拖尾。所以啊,要想解决这个问题,就得对症下药,把这些因素一个个排查掉。
提质粒的时候,要是出现拖带,可能是样品浓度过高了。这时候,简单的办法就是稀释一下样品,问题就能解决啦。
提基因组 DNA 时,拖带的情况也不少见。这可能是因为提取的 DNA 中掺杂了蛋白质,这些蛋白质会拽着 DNA 一起跑,所以就出现了拖带。所以,在提取 DNA 时,一定要注意操作,减少蛋白质等杂质的出现。
要是样品破碎或者被降解了,也会导致拖带。所以,在跑胶之前,一定要确保样品的状态良好。
还有一个可能,就是样品中残留了 RNA。RNA 会在 DNA 前面形成一片,经过纯化和 RNAse 处理,就能解决这个问题啦。
电泳体系也可能有问题哦!看看你的 marker 是否也有拖带现象,如果有,那就对照着来调整一下吧。比如说,电泳缓冲液 TAE 或 TBE 被污染了,就换个新的;上样时样品漂了,就增加上样缓冲液的用量,小心加样;电压太高了,就适当降低电压;凝胶浓度不合适,就根据核酸片断大小来调整一下。